====== 6MP / Neutropenia ======
* Updated on 2018.01.17
* 서울아산병원: pf.김혜리 (taban@hanmail.net)
* 서울의대: 유승원 (kyrie0710@snu.ac.kr)
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==== Samples ====
^ Project ^ Dept. ^ Date ^ Exp. type ^ Sample Type ^ #samples ^ Status ^ Raw data ^
^ 6MP | 2세부 | 15.02.02 | WXS | DNA | 124/125 | 실험 완료, 1명 failed | {{ :125_6mp_wxs.xlsx |125_ID}}|
^ ::: | ::: | 17.07.18 | WXS | DNA, Buffy coat | /62 | 실험 예정 | {{ :all_170718_62.xlsx |62_ID}} |
^ ::: | ::: | 17.09.12 | WXS | DNA, Buffy coat | 56/57 | 실험 완료, 1명 failed | {{ :snuh_170912_57.xlsx |57_info}} |
^ ::: | 3세부 | 16.11.01 | WXS | Bone Marrow | 119/121 | 실험 완료, 2명 failed | {{ :amc_161101_121.xlsx |121_info}} |
^ 합계 ^^^^^ 119/365 | |
* 중복 샘플
^ Project ^ Dept. ^ Date ^ Exp. type ^ Sample Type ^ #samples ^ Status ^ Raw data ^ Note ^
^ 6MP | 2세부 | 15.02.02 | 약물패널 | DNA | 46/46 | 실험 완료 | {{ :46_6mp_panel.xlsx |46_ID}} | 187 WXS에 샘플 포함 |
^ ::: | ::: | ::: | WXS | DNA | 10/10 | 실험 완료 | {{ :10_6mp_wxs.xlsx |10_ID}} | ::: |
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==== Progress ====
* 전체 365 샘플 수집
* WXS AMC 119 샘플 실험 완료
* 후보 바이오마커 6개 (ABCC4, APEX1, CYP1A1, CYP4F2, NUDT15, CRIM1) 발굴
* SNUH 185 샘플을 WXS 실험 진행하여 180개 샘플 실험 완료 -> Variant calling 진행 중
* Genotyping validation 실험 중